La posición de los diodos importa, tienes que ir girándolos hasta que veas que el haz de luz emitido es igual que el que producen las halógenas, por lo que suele ser buena idea hacer una foto al haz producido por las halógenas para tener algo real con lo que comparar. El problema de esto es que la bombilla LED se calienta rápido en la zona de disipación térmica (normalmente la carcasa del ventilador, en la mayoría de ellas), que es justo donde la agarras para girarlas, por lo que tienes que hacerlo medianamente rápido o utilizar unos guantes.
De todas formas, ¿estás seguro de haberlas colocado bien en el faro? Quiero decir, no en cuanto al giro de los diodos LED, sino la propia bombilla. ¿No es posible que se te haya quedado una de las tres pestañas fuera de su sitio? No es demasiado cómodo trastear por dentro del faro por el poco espacio que hay, y si se hace demasiado rápido o con poco cuidado te puede haber ocurrido algo así. Eso haría que apuntaras muy hacia arriba o muy hacia abajo, con el peligro doble de no ver bien y además deslumbrar al resto de conductores.