Nadie lo va a hacer y realmente no le va a pasar nada, como mucho va a tardar uno o dos segundos más en arrancar el multimedia ya que al tener conectado el pendrive al encenderse, va a comprobar si existe el fichero de actualización para lanzar el proceso, si no lo encuentra, sigue con el arranque normal y ya está.
a mi por no quitarlo se me estropeo uno, ( bueno no se estropeo, pero tuve que volver a ponerle la musica porque estaba dañado,) ahora lo que hago para no tener que sacarlo, es antes de parar el coche paso a la radio y ya al volver a arrancar se enciende la radio, no se si servira pero de momento no se ha vuelto a estropear.
Mi coche es de mayo del 2016. Desde entonces llego un pen drive SanDisk minusculo que apenas se puede coger, con casi 1000 canciones, siempre puesto y nunca he tenido ningun problema. Eso sí, la misma carpeta en el PC por si acaso.